BCT.03287.03 - Projektmodul Bioorganische Chemie und Enzymologie (Complete module description)

BCT.03287.03 - Projektmodul Bioorganische Chemie und Enzymologie (Complete module description)

Original version English
BCT.03287.03 15 CP
Module label Projektmodul Bioorganische Chemie und Enzymologie
Module code BCT.03287.03
Semester of first implementation
Faculty/Institute Institut für Biochemie und Biotechnologie
Module used in courses of study / semesters
  • Biochemie (MA120 LP) (Master) > Biochemie BiochemieMA120, Version of accreditation (WS 2010/11 - SoSe 2024) > Biochemische Wahlpflichtmodule
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation valid from SoSe 2023 > Biochemie (Anteil gem. § 5 Abs. 4-6, Anlage 2)
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation (WS 2009/10 - SS 2016) > Biochemie
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation (WS 2016/17 - WS 2022/23) > Biochemie
Responsible person for this module
Further responsible persons
Prof. Dr. F. Bordusa, Prof. Dr. M. Schutkowski, Dr. Sandra Liebscher, PD Dr. Cordelia Schiene-Fischer
Prerequisites
Skills to be acquired in this module
  • Spezielle Kenntnisse grundlegender bioorganischer Methoden zur Synthese und gezielten Modifizierung von Biomakromolekülen
  • Bedeutung synthetischer Biomakromoleküle für analytische, diagnostische und biomedizinische Anwendungen
  • Kenntnisse häufig verwendeter Chemosynthese- und Biokatalyse-Verfahren von Biomakromolekülen
  • Erlernen ausgewählter grundlegender bioorganischer Synthesemethoden und Arbeitstechniken
  • Vermittlung der theoretischen Grundlagen für die Dateninterpretation bei Kristallstrukturanalyse und Röntgenkleinwinkelstreuung
  • Spezielle Kenntnisse zu den chemischen und biochemischen Grundlagen der enzymatischen Katalyse
  • Vertiefende Kenntnisse zu den Katalyseprinzipien und ihre Charakterisierung an ausgewählten Enzymsystemen
  • Kenntnisse verschiedener Arten von Enzymeffektoren von Enzymsystemen an ausgewählten Beispielen und ihre Charakterisierung
  • Grundlegende Kenntnisse zu Hochdurchsatzverfahren zum Auffinden von Enzymeffektoren mit medizinischer Relevanz
Kenntnisse der Protokollführung, Nutzung relevanter Literatur, auch in englischer Sprache, Präsentation
Module contents
Projektseminare
a) Bioorganische Chemie:
  • Synthesemethoden von Peptiden, Kohlenhydraten und Nukleinsäuren und deren Anwendung
  • Festphasenpeptidsynthese
  • Kombinatorische Synthesestrategien und HTS-Screening
  • Chemische Proteinsynthese, Ligationsverfahren, chemische Modifizierungen
  • Enzymatische Synthesestrategien (ausgewählte Systeme, Enzymaktivität, -spezifität und -stabilität)
  • Optimierung von Enzymen für die organische Synthese (Immobilisierung, Substrat-, Medium- und Enzym-Engineering durch chemische Modifizierung, ortsgerichtete Mutagenese und evolutives Design an ausgewählten Beispielen)
  • Anwendungsbeispiele optimierter Enzymsysteme für bioorganische Synthesen
b) Enzymologie:
  • chemische und biochemische Katalyseprinzipien an ausgewählten Enzymsystemen
  • Struktur-Funktionsstudien von Effektoren ausgewählter Enzymsysteme
  • Analyse von Enzymeffektoren mit medizinischer Relevanz
  • Kinetische Studien zur Bestimmung mikroskopischer Geschwindigkeitskonstanten
  • Diskussion von Fallbeispielen aus der aktuellen Literatur
Praktikum
a) Bioorganische Chemie:
  • Praktische Kenntnis ausgewählter bioorganischer Synthesemethoden (Festphasensynthese, Peptidsynthese, kombinatorische Synthese etc.)
  • Ausgewählte Strategien zur kovalenten Modifizierung von Proteinen
  • Enzymatische Synthese mit Enzymvarianten, Reaktionsmonitoring und -analytik
  • Ligation ausgewählter Peptidfragmente
  • Methoden der Reinigung, Analytik und strukturellen Charakterisierung bioorganischer Syntheseprodukte
  • Nutzung relevanter Literatur
b) Enzymologie:
  • Spezielle Kenntnisse zur kinetischen und biophysikalischen Charakterisierung von enzymatischen Reaktionen in verschiedenen Analysesystemen
  • Praktische Kenntnisse zu Einzel- und Hochdurchsatz-Messungen enzymatischer Reaktionen unter Berücksichtigung der Effektoren
  • Anwendung von spektroskopischen Methoden zur Analyse von Enzym-Substrat und Enzym-Ligand Interaktionen
  • Nutzung relevanter Literatur
  • rechnergestützte Auswertung kinetischer und thermodynamischer Analysen
Forms of instruction Course (6 SWS)
Course (6 SWS)
Course
Languages of instruction German, English
Duration (semesters) 6 Wochen Semester
Module frequency jedes Sommersemester
Module capacity unrestricted
Time of examination
Credit points 15 CP
Share on module final degree Course 1: %; Course 2: %; Course 3: %.
Share of module grade on the course of study's final grade 1
Module course label Course type Course title SWS Workload of compulsory attendance Workload of preparation / homework etc Workload of independent learning Workload (examination and preparation) Sum workload
Course 1 Course Projektseminar Bioorganische Chemie 6 0
Course 2 Course Projektseminar Enzymologie 6 0
Course 3 Course Selbststudium 0
Workload by module 450 450
Total module workload 450
Examination Exam prerequisites Type of examination
Course 1
Course 2
Course 3
Final exam of module
Praktikumsleistung
mündl. Prüfung oder Vortrag oder Klausur
Exam repetition information
Prerequisites and conditions Prerequisites Frequency Compulsory attendance Share on module grade in percent
Course 1 Winter semester No %
Course 2 Winter semester No %
Course 3 Winter semester No %