INF.06457.04 - Grundlagen der Bioinformatik (Complete module description)

INF.06457.04 - Grundlagen der Bioinformatik (Complete module description)

Original version English
INF.06457.04 15 CP
Module label Grundlagen der Bioinformatik
Module code INF.06457.04
Semester of first implementation
Faculty/Institute Institut für Informatik
Module used in courses of study / semesters
  • Bioinformatik (180 LP) (Bachelor) > Bioinformatik Bioinformatik180, Version of accreditation valid from SS 2021 > Pflichtmodule
  • Bioinformatik (180 LP) (Bachelor) > Bioinformatik Bioinformatik180, Version of accreditation (WS 2018/19 - WS 2022/23) > Pflichtmodule
Responsible person for this module
Further responsible persons
PD. Dr. Jan Grau
Prerequisites
Skills to be acquired in this module
  • Mathematisches Grundlagenwissen als Voraussetzung für selbständiges Lernen und Arbeiten
  • Beherrschen der mathematischen Sprache
  • Erkennen von Zusammenhängen zwischen verschiedenen Gebieten und Konzepten der Mathematik, Informatik, Bioinformatik und Biowissenschaften
  • Förderung des logischen Denkens und Abstraktionsvermögens
  • Entwicklung des Verständnisses für Validierung und Erlernen von Beweistechniken und Problemlösestrategien
  • Überblick über die Breite bioinformatischer Fragestellungen
  • Verständnis grundlegender methodischer Ansätze zur Lösung bioinformatischer Probleme
  • Erkennen von Bezügen zwischen Grundlagenbereichen der Mathematik und Informatik und konkreten Problemstellungen der Bioinformatik
Module contents
  • Einführung in die Informatik und Bioinformatik: Was ist Informatik? Was ist Bioinformatik? Datum, Information, Signal, Semiotik, Wissen, Verantwortung von Bioinformatikerinnen und Bioinformatikern, Systembegriff, Modellbegriff, Prinzipien der Modellierung
  • Mengen, Relationen, Funktionen, Graphen und Bäume; Textersetzungssysteme, Grammatiken, Chomsky-Hierarchie, endliche Automaten, Strukturbäume; Monoide, Boolesche Algebra und Verbände; objekt-orientiertes Modellieren, UML-Diagramme, Klasseninvarianten; Petri-Netze
  • Wiederkehrende algorithmische Ansätze in der Bioinformatik: Greedy-Algorithmen, Dynamische Programmierung, Heuristische Verfahren; Grundlagen statistischer Datenauswertung; Grundlagen des überwachten und unüberwachten Lernens
  • Grundlegende bioinformatische Fragestellungen inklusive biologischer und experimenteller Hintergründe, entsprechende Lösungsstrategien und Datenauswertung in den Bereichen der Genomik, Epigenomik, Metagenomik, Transkriptomik, Proteomik, Metabolomik, Evolution und Phylogenie
Forms of instruction Lecture (2 SWS)
Exercises (2 SWS)
Lecture (2 SWS)
Exercises (2 SWS)
Course
Course
Course
Tutorial
Course
Seminar (1 SWS)
Languages of instruction German, English
Duration (semesters) 2 Semester Semester
Module frequency jedes Studienjahr beginnend im Wintersemester
Module capacity unrestricted
Time of examination
Credit points 15 CP
Share on module final degree Course 1: %; Course 2: %; Course 3: %; Course 4: %; Course 5: %; Course 6: %; Course 7: %; Course 8: %; Course 9: %; Course 10: %.
Share of module grade on the course of study's final grade 1
Reference text
zu den Studienleistungen: (nicht die eigene Lösung erklären können bzw. die Vorstellung ablehnen bedeutet, dass alle Aufgaben der Übungsserie als nicht bearbeitet gelten)
Module course label Course type Course title SWS Workload of compulsory attendance Workload of preparation / homework etc Workload of independent learning Workload (examination and preparation) Sum workload
Course 1 Lecture Mathematische Grundlagen der Informatik und Konzepte der Modellierung 1 2 0
Course 2 Exercises Übung 2 0
Course 3 Lecture Grundlagen der Bioinformatik 2 0
Course 4 Exercises Übung 2 0
Course 5 Course Selbststudium, Lösen von Übungsaufgaben 0
Course 6 Course Selbststudium, Lösen von Übungsaufgaben 0
Course 7 Course Klausurvorbereitung 0
Course 8 Tutorial Tutorium (fakultativ) 0
Course 9 Course Übungsaufgaben in vorlesungsfreier Zeit (Ferienübungsblatt) 0
Course 10 Seminar Seminar 1 0
Workload by module 450 450
Total module workload 450
Examination Exam prerequisites Type of examination
Course 1
Course 2
Course 3
Course 4
Course 5
Course 6
Course 7
Course 8
Course 9
Course 10
Final exam of module
Bearbeitung von mindestens 80% der Übungsaufgaben im WiSe und auf Anfrage erfolgreiche Vorstellung der Lösung einer bearbeiteten Aufgabe (siehe Hinweise), Bearbeitung von mindestens 80% der Übungsaufgaben im SoSe und auf Anfrage erfolgreiche Vorstellung der Lösung einer bearbeiteten Aufgabe (siehe Hinweise)
mündl. Prüfung oder Klausur
Exam repetition information
Prerequisites and conditions Prerequisites Frequency Compulsory attendance Share on module grade in percent
Course 1 Winter semester No %
Course 2 Winter semester No %
Course 3 Summer semester No %
Course 4 Summer semester No %
Course 5 Winter semester No %
Course 6 Summer semester No %
Course 7 Summer semester No %
Course 8 Summer or winter semester No %
Course 9 Winter semester No %
Course 10 Winter semester No %