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CHE.00012.03 - Vertiefung in der Fachrichtung Organische Chemie (OC-M-V) (Complete module description)
Original version English
CHE.00012.03 25 CP
Module label Vertiefung in der Fachrichtung Organische Chemie (OC-M-V)
Module code CHE.00012.03
Semester of first implementation
Faculty/Institute Institut für Chemie
Module used in courses of study / semesters
  • Chemie (MA120 LP) (Master) > Chemie ChemieMA120, Version of accreditation valid from WS 2006/07 > Vertiefungsrichtungen
Responsible person for this module
Further responsible persons
Prof. Dr. Konstantin Amsharov
Prerequisites
Skills to be acquired in this module
  • Kenntnis und Verständnis der grundlegenden Konzepte der Supramolekularen Chemie und der Strukturbildung durch nichtkovalente Wechselwirkungen.
  • Anwendung des Wissens über nichtkovalente Wechselwirkungen und Selbstassemblierungsprozesse auf biologische Selbstorganisation und Strukturbildung
  • Erwerb fundierten Wissens über die Anwendung kinetischer Methoden für mechanistische Untersuchungen, sowie zur Reaktionsplanung und -optimierung
  • Kenntnis strahlenchemischer Prozesse und ihrer Implikationen für chemische und biochemische Systeme
  • Erlernen der Isolation einzelner Prozesse in komplexen Systemen
  • Kenntnisse über biokatalytische Umsetzungen, sowie deren Vor- und Nachteile
  • Fundiertes Wissen über enzymatische Prinzipien und Reaktionsmechanismen
  • Anwendung des Wissens über enzymatische Umsetzungen auf zukünftige Syntheseplanungen
Module contents
Die folgenden Inhalte werden in den drei Vorlesungen `Chemoenzymatik`, `Supramolekulare Chemie` und `Experimentelle und theoretische chemische Kinetik` behandelt.
  • Intermolekulare Wechselwirkungen und Selbstassemblierung: Wasserstoffbrücken und elektrostatische Wechselwirkungen, pi-pi-Wechselwirkungen, Dispersionswechselwirkungen und hydrophober Effekt, Entropieeffekte, kooperative Effekte, Lösungsmitteleffekte
  • Wirt-Gast Systeme und molekulare Erkennung: Bindung von Kationen, Anionen, Ionophore und Ionenkanäle, Allosterie, kooperative Effekte, Vororganisation, Rezeptoren, Sensoren
  • Bindung von polaren und unpolaren Neutralmolekülen, Cyclophane, Calixarene, Cyclodextrine, und Karzeranden
  • Bindung von Ammoniumsalzen und Acetylcholin
  • Self-assembly, selbstassemblierte Netzwerke und Kapseln, Rotaxane, Catenane, Knotane und molekulare Maschinen
  • Template, dynamische kombinatorische Bibliotheken und Autokatalyse, dynamische kovalente Bindungen
  • Selbst-assermblierung von Dendrimeren und Dendronen
  • Amphiphile Selbstassemblierung in niedermolekularen und makromolekularen Systemen, lamellare, kolumnare und kubische Phasen, Vesikel und micellare Systeme, Grenzflächen und deren Krümmung, Frustrationsphenomäne und Entwicklung von Komplexität
  • Selbstassemlierte Systeme mit Orientieriungsfernordnung: lamellare, columnare und kubische ferroelektrische und chirale Flüssigkristallsysteme and deren Anwendungen
  • Aspekte der Selbstassemblierung in Biosystemen (DNA-struktur, Proteinfaltung, Zell-zellerkennung, Zellmembranen und Ionenkanäle)
  • Selbstorganisation und Hypothesen der spontanen Entstehung von Leben und einheitlicher Chiralität
  • Methoden der schnellen Kinetik, ihre apparativen Realisierungen, und ihre Anwendungsbereiche:
a) Strömungsmethoden (continuous flow und stopped flow)
b) aperiodische Relaxationsverfahren (Temperatur-, Druck-, und Feldsprung)
c) periodische Relaxationsverfahren (Ultraschallabsorption und Feldmodulation)
d) Laserblitzlichtphotolyse
e) strahlenchemische Methoden; Besonderheiten der Strahlenchemie im Vergleich mit der Photochemie
f) elektrochemische Methoden (rotierende Scheibe, Ringscheibenelektrode, Polarographie, Cyclovoltammetrie)
g) NMR-Methoden (dynamische NMR, CIDNP-Spektroskopie)
  • Theorie der Kinetik:
a) Zusammenspiel von Diffusion und Reaktion; Diffusionskorrektur gemessener Geschwindigkeitskonstanten; Diffusionskontrolle (Einstein-Smoluchowski-Beziehung und Debye-Korrektur); Radikalpaarmechanismus
b) Beziehungen zwischen Thermodynamik und Kinetik (Bronstedtbeziehung, Rehm-Weller-Gleichung, Marcustheorie)
c) Beziehungen zwischen Struktur und Reaktivität (LFER, Hammett-Beziehungen, Taft-Gleichung)
d) Isotopeneffekte
e) Reaktionen in Micellen (formalkinetische Herleitung der Poisson-Statistik, Infelta-Tachiya-Gleichung
  • Anwendungsbeispiele (z.B. Neutralisationsreaktion, Micellbildung, Gramicidin-vermittelter Stofftransport durch Biomemembranen, Eigen-Tamm-Mechanismus, Elektronen- und Protonenselbstaustausch, polarisierte Kernspins als Sonden zur Verfolgung von Umlagerungsreaktionen, Photoionisierungen und Einsatz hydratisierter Elektronen bzw. Hydroxylradikale für Synthesen und zum Schadstoffabbau)
0. Einleitung:
- Konzepte und Theorien zum Übergang von organischer Chemie zur Biologie (`Chemische Evolution`)
- Grundprinzipien der gerichteten Evolution
1. Gruppentransfer Reaktionen
- Esterhydrolyse: Parallelen der enzymatischen Hydrolyse mit der säurekatalysierten und basischen Hydrolyse
- Dazu: pKA Veränderungen im aktiven Zentrum sowie weitere Prinzipien der Enzyme um hohe pKA zu überwinden
- Amid Hydrolyse und Amidierung
2. Reduktion/Oxidation
- Gegenüberstellung von NAD(P)H sowie Flavin mit chemischen Reduktionsmitteln
- Flavoenzyme und deren Anwendung
- Reduktive Aminierung mittels Transaminasen, dazu Sitagliptin Synthese
- Reduktion von C=C Doppelbindungen
3. Monooxygenierung (Oxidation)
- Häm-abhängige Monooxygenasen vs. neueste chemische Methoden zur selektiven C-H Hydroxylierung
- Das Problem des `HOplus `: Alternative in der Chemie durch Baeyer-Villiger, Flavoenzyme als Alternative `HOplus ` Quellen, bsp L-Dopa Synthese
- Baeyer-Villiger Reaktion
4. Dioxygenierung (Oxidation)
- Sharpless Dihydroxylierung
- Aktivität und Anwendung der verschiedenen Dioxygenasen
5. Prinzipien und Voraussetzungen für die Anwendung von Enzymen in organisch-chemischen Synthesen
  • Fachwissen über die theoretischen und methodischen Ansätze zur Syntheseplanung, sowie der Beschreibung und Untersuchung von Reaktionsmechanismen
  • Aspekte der retroanalytischen Syntheseplanung
Praktikum OC-M-V:
Durchführung von forschungsnahen Experimenten der organischen Chemie. Das Praktikum wird individuell mit den Studierenden zusammengestellt und kann Arbeiten aus allen Arbeitsgruppen der organischen Chemie umfassen.
Forms of instruction Lecture (2 SWS)
Course
Lecture (2 SWS)
Course
Lecture (2 SWS)
Course
Practical training (19 SWS)
Exercises (1 SWS)
Course
Languages of instruction German, English
Duration (semesters) 1 Semester Semester
Module frequency jedes Wintersemester
Module capacity unlimited
Time of examination
Credit points 25 CP
Share on module final degree Course 1: %; Course 2: %; Course 3: %; Course 4: %; Course 5: %; Course 6: %; Course 7: %; Course 8: %; Course 9: %.
Share of module grade on the course of study's final grade 1
Module course label Course type Course title SWS Workload of compulsory attendance Workload of preparation / homework etc Workload of independent learning Workload (examination and preparation) Sum workload
Course 1 Lecture Vorlesung `Chemoenzymatik` 2 0
Course 2 Course Selbststudium Vorlesung 0
Course 3 Lecture Vorlesung `Supramolekulare Chemie` 2 0
Course 4 Course Selbststudium zur Übung 0
Course 5 Lecture Vorlesung `Exp. u. theoret. Chem. Kinetik` 2 0
Course 6 Course Selbststudium Vorlesung 0
Course 7 Practical training Praktikum `Moderne Synthesemethoden` 19 0
Course 8 Exercises Übung zum Praktikum 1 0
Course 9 Course Selbststudium zum Praktikum 0
Workload by module 750 750
Total module workload 750
Examination Exam prerequisites Type of examination
Course 1
Course 2
Course 3
Course 4
Course 5
Course 6
Course 7
Course 8
Course 9
Final exam of module
Praktikumsbericht, Seminarvortrag
mündl. Prüfung oder Klausur
Exam repetition information
Prerequisites and conditions Prerequisites Frequency Compulsory attendance Share on module grade in percent
Course 1 Winter semester No %
Course 2 Winter semester No %
Course 3 Winter semester No %
Course 4 Winter semester No %
Course 5 Winter semester No %
Course 6 Winter semester No %
Course 7 Winter semester No %
Course 8 Winter semester No %
Course 9 Winter semester No %