BCT.03310.03 | 15 CP |
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Module label | Projektmodul Strukturbiologie und Bioinformatik |
Module code | BCT.03310.03 |
Semester of first implementation | |
Faculty/Institute | Institut für Biochemie und Biotechnologie |
Module used in courses of study / semesters |
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Responsible person for this module | |
Further responsible persons |
Prof. Dr. Milton T. Stubbs |
Prerequisites | |
Skills to be acquired in this module |
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Module contents | Projektseminare, Seminare und Praktika zu folgenden Lerninhalten
o Proteinfaltung o Proteinabbau o Energieerzeugung o Biosynthese von Naturstoffen
o Ligand-basiertes Wirkstoffdesign o Docking-Verfahren
o Spektroskopische und thermodynamische Analyse von Biomakromolekülen und ihren Wechselwirkungen o Computermethoden in der Strukturanalyse o Interpretation von experimentellen Daten der Röntgenkristallstrukturanalyse: Aufbau der atomaren Struktur eines Proteins, kritische Bewertung der resultierenden Ergebnisse o Vertiefung des Verständnisses allgemeingültiger Prinzipien der Struktur und Stabilität von Proteinen (Strukturelemente, zugrundeliegende Wechselwirkungen) o Erarbeitung von Struktur-/Funktionsbeziehungen von ausgewählten Proteinstrukturen o Kraftfeldverfahren, Optimierungsmethoden, Konformationssuche, Moleküldynamik- und Monte Carlo-Simulationen o Sequenzalignment, Sekundär- und Tertiärstrukturvorhersage von Proteinen, Validierung von Proteinstrukturen o Grundlagen der Massenspektrometrie: Aufbau eines Massenspektrometers, Kennwerte eines Massenspektrometers, Aufbau von Ionenquellen und Analysatorsystemen, Hybrid-Massenspektrometer, Detektoren, Ionisierungsarten, MS/MS-Techniken o Massenspektrometrie von Peptiden und Proteinen: Elektrosprayionisierung(ESI) und Matrix-unterstützte Laserdesorption/Ionisierung (MALDI), Sequenzierung von Peptiden mittels MS/MS, Fragmentierungsarten wie CID,PSD,ISD und ETD, Nomenklatur der Fragmentierung von Peptiden, Analyse von Phosphopeptiden und Glycopeptiden o Proteomics: Peptide-Mass-Fingerprint, Kopplung LC-MS/MS, quantitative Proteomics, stabile Isotopenmarkierung in vivo (SILAC) und in vitro (iTRAQ, MeCat, ICAT, isotopenmarkierte Standard-Peptide (AQUA) o native Massenspektrometrie, chemisches Cross-linking, H/D-Austausch-Massenspektrometrie o neue Ionisierungs-und Imaging-Methoden |
Forms of instruction |
Seminar (2 SWS)
Course (10 SWS) Course |
Languages of instruction | German, English |
Duration (semesters) | 6 Wochen Semester |
Module frequency | nicht festlegbar |
Module capacity | unlimited |
Time of examination | |
Credit points | 15 CP |
Share on module final degree | Course 1: %; Course 2: %; Course 3: %. |
Share of module grade on the course of study's final grade | 1 |
Module course label | Course type | Course title | SWS | Workload of compulsory attendance | Workload of preparation / homework etc | Workload of independent learning | Workload (examination and preparation) | Sum workload |
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Course 1 | Seminar | Literaturseminar, Ergebnispräsentation | 2 | 0 | ||||
Course 2 | Course | Projektseminar | 10 | 0 | ||||
Course 3 | Course | Selbststudium | 0 | |||||
Workload by module | 450 | 450 | ||||||
Total module workload | 450 |
Examination | Exam prerequisites | Type of examination | |
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Course 1 | |||
Course 2 | |||
Course 3 | |||
Final exam of module | Versuchstestate und Protokolle (max. 1 Wdhlg.), 2 Literaturvorträge |
mündl. Prüfung oder Vortrag oder Klausur |
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Exam repetition information |
Prerequisites and conditions | Prerequisites | Frequency | Compulsory attendance | Share on module grade in percent |
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Course 1 | Winter semester | No | % | |
Course 2 | Winter semester | No | % | |
Course 3 | Winter semester | No | % |