MLU
INF.08066.02 - Phylogenomik und Phylotranskriptomik (Vollständige Modulbeschreibung)
Originalfassung Englisch
INF.08066.02 5 CP
Modulbezeichnung Phylogenomik und Phylotranskriptomik
Modulcode INF.08066.02
Semester der erstmaligen Durchführung
Fachbereich/Institut Institut für Informatik
Verwendet in Studiengängen / Semestern
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Akkreditierungsfassung gültig ab SoSe 2023 > Bioinformatik (HI) (Anteil gem. § 5 Abs. 4-6, Anlage 2)
  • Informatik (MA120 LP) (Master) > Informatik InformatikMA120, Akkreditierungsfassung gültig ab SoSe 2023 > Vertiefende Module der Vertiefungsrichtung `Bioinformatik`
  • Nutzpflanzenwissenschaften (MA120 LP) (Master) > Agrarwissenschaft/Landwirtschaft Nutzpflanzenwiss.MA120, Akkreditierungsfassung gültig ab WS 2018/19 > Wahlpflichtmodule
Modulverantwortliche/r
Weitere verantwortliche Personen
Prof. Dr. Ivo Große
Teilnahmevoraussetzungen
Statistische Datenanalyse (Besuch)
Kompetenzziele
  • Die Studierenden verstehen populäre Algorithmen derder Phylogenomik und Phylotranskriptomik und die dahinter liegenden Konzepte.
  • Sie sind in der Lage, diese Konzepte und Algorithmen auf konkrete Problemstellungen der der Phylogenomik und Phylotranskriptomik anzuwenden.
  • Sie haben die Fähigkeit, diese Konzepte und Algorithmen zukünftigen Kooperationspartnerinnen und Kooperationspartnern zu erklären.
  • Sie haben die Kompetenz, diese Konzepte und Algorithmen weiterzuentwickeln und auf neue Problemstellungen der der Phylogenomik und Phylotranskriptomik anzuwenden.
Modulinhalte
  • Molekulare Basis der Evolution, Mutationen, Selektion
  • Modelle der Evolution von DMA-Sequenzen (Jukes-Cantor, Kimura, Felsenstein, Hasegawa-Kishino-Yano)
  • Modelle der Evolution von RNA-Expressionsprofilen (Ornstein-Uhlenbeck)
  • Phylogenetische Bäume und Rekonstruktion Phylogenetischer Bäume
  • Phylogenetische Netzwerke und Rekonstruktion Phylogenetischer Netzwerke
Lehrveranstaltungsformen Seminar (2 SWS)
Kursus
Übung (2 SWS)
Übung
Unterrichtsprachen Deutsch, Englisch
Dauer in Semestern 1 Semester Semester
Angebotsrhythmus Modul jedes Wintersemester
Aufnahmekapazität Modul unbegrenzt
Prüfungsebene
Credit-Points 5 CP
Modulabschlussnote LV 1: %; LV 2: %; LV 3: %; LV 4: %.
Faktor der Modulnote für die Endnote des Studiengangs 1
Hinweise
Vertiefendes Modul für die Vertiefungsrichtung Bioinformatik
Modulveran­staltung Lehrveranstaltungs­form Veranstaltungs­titel SWS Workload Präsenz Workload Vor- / Nach­bereitung Workload selbstge­staltete Arbeit Workload Prüfung incl. Vorbereitung Workload Summe
LV 1 Seminar Seminar 2 0
LV 2 Kursus Selbststudium 0
LV 3 Übung Übung 2 0
LV 4 Übung Bearbeiten der Übungsaufgaben 0
Workload modulbezogen 150 150
Workload Modul insgesamt 150
Prüfung Prüfungsvorleistung Prüfungsform
LV 1
LV 2
LV 3
LV 4
Gesamtmodul
Aktive Teilnahme an den Übungen, Erfolgreiches Lösen der Übungs- und Programmieraufgaben, Erfolgreiches Vorrechnen und Erklären der Lösungen, 50% der Punkte der Übungsaufgaben
mündl. Prüfung oder Klausur
Wiederholungsprüfung
Regularien Teilnahme­voraussetzungen Angebots­rhythmus Anwesenheits­pflicht Gewicht an Modulnote in %
LV 1 Wintersemester Nein %
LV 2 Wintersemester Nein %
LV 3 Wintersemester Nein %
LV 4 Wintersemester Nein %