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BCT.03287.02 - Projektmodul Bioorganische Chemie und Enzymologie (Complete module description)
Original version English
BCT.03287.02 15 CP
Module label Projektmodul Bioorganische Chemie und Enzymologie
Module code BCT.03287.02
Semester of first implementation
Faculty/Institute Institut für Biochemie und Biotechnologie
Module used in courses of study / semesters
  • Biochemie (MA120 LP) (Master) > Biochemie BiochemieMA120, Version of accreditation valid from WS 2010/11 > Biochemische Wahlpflichtmodule
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation valid from SoSe 2023 > Biochemie (Anteil gem. § 5 Abs. 4-6, Anlage 2)
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation (WS 2009/10 - SS 2016) > Biochemie
  • Bioinformatik (MA120 LP) (Master) > Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation (WS 2016/17 - WS 2022/23) > Biochemie
Responsible person for this module
Further responsible persons
Prof. Dr. F. Bordusa, Prof. Dr. M. Schutkowski, Dr. Sandra Liebscher, PD Dr. Stephan König
Prerequisites
Skills to be acquired in this module
  • Spezielle Kenntnisse grundlegender bioorganischer Methoden zur Synthese und gezielten Modifizierung von Biomakromolekülen
  • Bedeutung synthetischer Biomakromoleküle für analytische, diagnostische und biomedizinische Anwendungen
  • Kenntnisse häufig verwendeter Chemosynthese- und Biokatalyse-Verfahren von Biomakromolekülen
  • Erlernen ausgewählter grundlegender bioorganischer Synthesemethoden und Arbeitstechniken
  • Spezielle Kenntnisse der biophysikalischen Methoden Proteinkristallstrukturanalyse und Röntgenkleinwinkelstreuung mit Synchrotronstrahlung
  • Vertiefende Kenntnisse zur Strategie von Proteinreinigung und -charakterisierung
  • Kenntnisse über die Probenvorbereitung für Proteinkristallisation und Röntgenkleinwinkelstreuexperimente
  • Vermittlung der theoretischen Grundlagen für die Dateninterpretation bei Kristallstrukturanalyse und Röntgenkleinwinkelstreuung
  • Kenntnisse der Protokollführung, Nutzung relevanter Literatur, auch in englischer Sprache, Präsentation
Module contents
Projektseminare
a) Bioorganische Chemie:
  • Synthesemethoden von Peptiden, Kohlenhydraten und Nukleinsäuren und deren Anwendung
  • Festphasenpeptidsynthese
  • Kombinatorische Synthesestrategien und HTS-Screening
  • Chemische Proteinsynthese, Ligationsverfahren, chemische Modifizierungen
  • Enzymatische Synthesestrategien (ausgewählte Systeme, Enzymaktivität, -spezifität und -stabilität)
  • Optimierung von Enzymen für die organische Synthese (Immobilisierung, Substrat-, Medium- und Enzym-Engineering durch chemische Modifizierung, ortsgerichtete Mutagenese und evolutives Design an ausgewählten Beispielen)
  • Anwendungsbeispiele optimierter Enzymsysteme für bioorganische Synthesen
b) Enzymologie:
  • chemische und biochemische Katalyseprinzipien an ausgewählten Enzymsystemen
  • Probenvorbereitung für die beiden speziellen biophysikalischen Methoden Kristallstrukturanalyse und Röntgenkleinwinkelstreuung
  • Biochemiker als Nutzer von Messplätzen in Großforschungseinrichtungen (bes. Synchrotronanlagen)
  • Struktur-Funktionsstudien an ausgewählten Beispielen von allosterischen Enzymsystemen
  • Kinetische Studien zur Bestimmung mikroskopischer Geschwindigkeitskonstanten
  • Diskussion von Fallbeispielen aus der aktuellen Literatur
Praktikum
a) Bioorganische Chemie:
  • Praktische Kenntnis ausgewählter bioorganischer Synthesemethoden (Festphasensynthese, Peptidsynthese, kombinatorische Synthese etc.)
  • Ausgewählte Strategien zur kovalenten Modifizierung von Proteinen
  • Enzymatische Synthese mit Enzymvarianten, Reaktionsmonitoring und -analytik
  • Ligation ausgewählter Peptidfragmente
  • Methoden der Reinigung, Analytik und strukturellen Charakterisierung bioorganischer Syntheseprodukte
  • Nutzung relevanter Literatur
b) Enzymologie:
  • Praktische Kenntnisse zur Expression, Reinigung und Kristallisation von Enzymen
  • Spezielle Kenntnisse zur kinetischen und biophysikalischen Charakterisierung von enzymatischen Reaktionen
  • Selbständige Entwicklung von Reinigungsstrategien für Enzyme
  • Spektroskopische Methoden zur Analyse von Enzym-Substrat und Enzym-Ligand Interaktionen
  • Nutzung relevanter Literatur
  • rechnergestützte Auswertung kinetischer und thermodynamischer Analysen
Forms of instruction Course (6 SWS)
Course (6 SWS)
Course
Languages of instruction German, English
Duration (semesters) 6 Wochen Semester
Module frequency nicht festlegbar
Module capacity unlimited
Time of examination
Credit points 15 CP
Share on module final degree Course 1: %; Course 2: %; Course 3: %.
Share of module grade on the course of study's final grade 1
Module course label Course type Course title SWS Workload of compulsory attendance Workload of preparation / homework etc Workload of independent learning Workload (examination and preparation) Sum workload
Course 1 Course Projektseminar Bioorganische Chemie 6 0
Course 2 Course Projektseminar Enzymologie 6 0
Course 3 Course Selbststudium 0
Workload by module 450 450
Total module workload 450
Examination Exam prerequisites Type of examination
Course 1
Course 2
Course 3
Final exam of module
Versuchstestate und Protokolle (max. 1 Wdh.), mündlicher Literaturvortrag
mündl. Prüfung oder Vortrag oder Klausur
Exam repetition information
Prerequisites and conditions Prerequisites Frequency Compulsory attendance Share on module grade in percent
Course 1 Winter semester No %
Course 2 Winter semester No %
Course 3 Winter semester No %