INF.00893.09 - Algorithmen auf Sequenzen I (Vollständige Modulbeschreibung)
INF.00893.09
5 CP
Modulbezeichnung Algorithmen auf Sequenzen I
Modulcode INF.00893.09
Semester der erstmaligen Durchführung
Fachbereich/Institut Institut für Informatik
Verwendet in Studiengängen / Semestern
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Mathematik (180 LP) (Bachelor) > Mathematik Mathematik180, Akkreditierungsfassung gültig ab WS 2019/20 > Anwendungsfach Informatik
Mathematik (180 LP) (Bachelor) > Mathematik Mathematik180, Akkreditierungsfassung (WS 2013/14 - SS 2022) > Anwendungsfach Informatik
Mathematik mit Anwendungsfach (180 LP) (Bachelor) > Mathematik Mathematik m. Anw.fach180, Akkreditierungsfassung (WS 2006/07 - SS 2013) > Anwendungsfach Informatik
Modulverantwortliche/r
Weitere verantwortliche Personen
Prof. Dr. Ivo Große
Teilnahmevoraussetzungen Objektorientierte Programmierung (Studienleistung), Datenstrukturen und effiziente Algorithmen I (Studienleistung)
Kompetenzziele Die Studierenden verstehen die Funktionsweise der grundlegenden Algorithmen zum exakten und approximativen Sequenzvergleich und erläutern deren Eigenschaften. Sie können diese Methoden anhand ihrer Eigenschaften vergleichen und geeignete Verfahren für gegebene Problemstellungen auswählen. Sie sind in der Lage, insbesondere deren Komplexität zu bestimmen. Die Studierenden können Fragestellungen aus den Biowissenschaften geeignet modellieren, um sie mittels Methoden des Sequenzvergleichs zu lösen.
Modulinhalte Boyer-Moore-Algorithmus zum exakten Sequenzvergleich Suffix-Bäume, generalisierte Suffix-Bäume, Suffix-Arrays Anwendungen exakter Sequenzvergleiche in der Bioinformatik globales, semi-globales, lokales paarweises Alignment; Lösungen mit Dynamischer Programmierung multiples Alignment; Lösungen mit Dynamischer Programmierung, Center-Star-Verfahren, Clustal Anwendungen approximativer Sequenzvergleiche in der Bioinformatik
Lehrveranstaltungsformen
Vorlesung (2 SWS)
Unterrichtsprachen
Deutsch, Englisch
Dauer in Semestern 1 Semester Semester
Angebotsrhythmus Modul jedes Sommersemester
Aufnahmekapazität Modul unbegrenzt
Prüfungsebene
Credit-Points 5 CP
Modulabschlussnote
LV 1 : LV 2 : LV 3 : LV 4 :
Faktor der Modulnote für die Endnote des Studiengangs 1
Modulveranstaltung
Lehrveranstaltungsform
Veranstaltungstitel
SWS
Workload Präsenz
Workload Vor- / Nachbereitung
Workload selbstgestaltete Arbeit
Workload Prüfung incl. Vorbereitung
Workload Summe
LV 1 Vorlesung
Vorlesung
2
0
LV 2 Kursus
Selbststudium zur Vorlesung
0
LV 3 Übung
Übung
2
0
LV 4 Kursus
Bearbeiten der Übungsaufgabe
0
Workload modulbezogen 150
150
Workload Modul insgesamt 150
Prüfung
Prüfungsvorleistung
Prüfungsform
LV 1
LV 2
LV 3
LV 4
Gesamtmodul
Erfolgreiches Lösen von Übungsaufgaben, Erfolgreiches Vorrechnen von Übungsaufgaben in den Übungen, aktive Teilnahme
mündl./schriftl. Prüfung
Wiederholungsprüfung
Regularien
Teilnahmevoraussetzungen
Angebotsrhythmus
Anwesenheitspflicht
Gewicht an Modulnote in %
LV 1
Sommersemester
Nein
%
LV 2
Sommersemester
Nein
%
LV 3
Sommersemester
Nein
%
LV 4
Sommersemester
Nein
%
