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Exercises: Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen (Übung) - Details
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General information

Course name Exercises: Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen (Übung)
Semester WS 2018/19
Current number of participants 4
Home institute Leitung des Instituts für Informatik
participating institutes Bioinformatik
Courses type Exercises in category Offizielle Lehrveranstaltungen
First date Friday, 19.10.2018 12:15 - 13:45
Pre-requisites Statistische Datenanalyse in der Bioinformatik II
Performance record Scheinerwerb durch aktive Teilnahme an den Übungen und Lösung der Aufgaben
Studiengänge (für) Master Bioinformatik,
Master Informatik,
Master Nutzpflanzenforschung
SWS 2

Rooms and times

Seminarraum 1.03 [VSP 1] (Informatik)
Wednesday: 14:15 - 15:45, weekly (5x)
Friday, 18.01.2019 12:15 - 13:45
No room preference
Wednesday: 14:15 - 15:45, weekly
(Raum 2.25 VSP 1)
Tuesday, 30.10.2018 12:15 - 13:45
Tuesday, 30.10.2018 14:15 - 15:45
Kolloquium 5.09 [VSP 1]
Thursday, 17.01.2019 10:15 - 11:45

Module assignments

Comment/Description

In der Vorlesungen werden ausgewählte Probleme der Sequenzanalyse wie z. B. die Erkennung von Spleißstellen oder Transkriptionsfaktorbindungsstellen behandelt. Methodisch werden verschiedene stochastische Modelle wie z. B. PWM-Mischmodelle oder Modelle für cis-regulatorische Module diskutiert. Für diese Modelle werden EM-Algorithmen zum Parameterlernen hergeleitet und auf verschiedene Datensätze angewendet.