Vorlesung: Probabilistic Graphical Models (Gastmodul Bioinformatik A) - Details

Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname	Vorlesung: Probabilistic Graphical Models (Gastmodul Bioinformatik A)
Semester	SS 2013
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden	4
Heimat-Einrichtung	Bioinformatik
beteiligte Einrichtungen	Institut für Informatik
Veranstaltungstyp	Vorlesung in der Kategorie Offizielle Lehrveranstaltungen
Erster Termin	Montag, 24.06.2013 10:00 - 14:00
Voraussetzungen	Molekulare Phylogenie
Leistungsnachweis	- Scheinerwerb durch Lösung der Aufgaben und aktive Teilnahme an den Übungen - mündliche Prüfung
Studiengänge (für)	Master Bioinformatik
SWS	3

Lehrende

• Prof. Dr. Ivo Grosse
• Dipl.-Bioinform. Yvonne Pöschl

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe

Montag: 10:00 - 14:00, wöchentlich(3x)

Studienbereiche

• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik

Kommentar/Beschreibung

In the last twenty years, Probabilistic Graphical Models (PGMs) have emerged as a most effective tool for solving artificial intelligence problem in general and in particular for bioinformatics applications. This course introduces what PGMs are and reviews the different types of questions that we can answer through its use. We cover algorithms that allow us to provide an exact answer to such questions, and establish when this answer can be provided in polynomial time. For those cases when no polynomial time exact algorithm exists, we review approximate inference techniques. In particular, we concentrate on structured variational approaches and variational expectation maximization. Along the course, exercise sessions will be used to show how the theoretical results in the lectures can be applied to particular bioinformatics problems, with an emphasis in molecular phylogenetics.