Übung: Probabilistic Graphical Models (Gastmodul Bioinformatik A), Übung - Details

Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname	Übung: Probabilistic Graphical Models (Gastmodul Bioinformatik A), Übung
Semester	SS 2013
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden	3
Heimat-Einrichtung	Bioinformatik
beteiligte Einrichtungen	Institut für Informatik
Veranstaltungstyp	Übung in der Kategorie Offizielle Lehrveranstaltungen
Erster Termin	Donnerstag, 20.06.2013 14:00 - 16:00
Voraussetzungen	Molekulare Phylogenie
Leistungsnachweis	- Scheinerwerb durch Lösung der Aufgaben und aktive Teilnahme an den Übungen
Studiengänge (für)	Master Bioinformatik
SWS	1

Lehrende

• Prof. Dr. Ivo Grosse
• Dipl.-Bioinform. Yvonne Pöschl

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe

Dienstag: 12:00 - 14:00, wöchentlich(3x)

Donnerstag: 14:00 - 16:00, wöchentlich(4x)

Studienbereiche

• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik

Kommentar/Beschreibung

In the last twenty years, Probabilistic Graphical Models (PGMs) have emerged as a most effective tool for solving artificial intelligence problem in general and in particular for bioinformatics applications. This course introduces what PGMs are and reviews the different types of questions that we can answer through its use. We cover algorithms that allow us to provide an exact answer to such questions, and establish when this answer can be provided in polynomial time. For those cases when no polynomial time exact algorithm exists, we review approximate inference techniques. In particular, we concentrate on structured variational approaches and variational expectation maximization. Along the course, exercise sessions will be used to show how the theoretical results in the lectures can be applied to particular bioinformatics problems, with an emphasis in molecular phylogenetics.