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Lecture: Angewandte Bioinformatik mit Perl und R - Details
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General information

Course name Lecture: Angewandte Bioinformatik mit Perl und R
Subtitle im Thin-Client-Pool
Semester WS 2008/09
Current number of participants 1
expected number of participants 15
Home institute Bioinformatik
participating institutes Institut für Informatik, Praktische Informatik (Bioinformatik)
Courses type Lecture in category Offizielle Lehrveranstaltungen
First date Thursday, 09.10.2008 10:15 - 11:00
Participants - wahlobl. für das 5. oder 7. Semester Bioinformatik
Performance record Scheinerwerb durch aktive Teilnahme an den Übungen und Lösung der Aufgaben
SWS 2
Miscellanea Bei größerer Nachfrage kann eventuell eine zweite Übungsgruppe eingeführt werden

Rooms and times

No room preference
Thursday: 10:15 - 11:00, weekly(15x)

Comment/Description

In der Veranstaltungen werden konkrete Aufgabenstellung aus
der Informatik mit den Programmiersprachen bzw - umgebungen
Perl/BioPerl und R/Bioconductor gearbeitet.
Als Anwendungen werden behandelt:
Manipulation von Sequenzen
Parsen von Daten- und Ergebnisdateien
Konversion zwischen Fileformaten
Filtern und Vergleichen von Datensätzen
Datenbankanbindungen

Analyse von Expressionsprofilen:
Aufbereitung und Normalisierung
Visualisierung von
Detektion signifikanter Gene
Clustern

Im Lauf der Veranstaltung werden schrittweise die programmiersprachlichen
Konzepte und der erforderliche methodische Hintergrund
für die Fragestellungen eingeführt.
Die Studierenden sollen intensiv sowohl in der Übung wie im Selbststudium
die erlernten Techniken in konkreten Projekten praktisch umsetzen.

Admission settings

The course is part of admission "Anmeldung gesperrt (global)".
The following rules apply for the admission:
  • Admission locked.