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Lecture: Information Retrieval in der Bioinformatik - Details
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General information

Course name Lecture: Information Retrieval in der Bioinformatik
Semester SS 2008
Current number of participants 0
Home institute Leitung des Instituts für Informatik
participating institutes Bioinformatik, Institut für Informatik, Praktische Informatik (Bioinformatik), Praktische Informatik (Datenbanken)
Courses type Lecture in category Offizielle Lehrveranstaltungen
First date Thursday, 10.04.2008 10:15 - 11:45
Learning organisation Zum Abschluss wird in der vorlesungsfreien Zeit eine grosse Programmieraufgabe im Team zu bearbeiten sein. Termin wird in der Vorlesung abgesprochen.
SWS 2+2

Rooms and times

No room preference
Thursday: 10:15 - 11:45, weekly(14x)

Fields of study

Comment/Description

Information Retrieval ist in der populären Version der Web-Suche bekannt. Die Vorlesung führt im ersten Teil in Grundlagen des Information Retrieval ein. Dies sind Modelle zur Repräsentation von Dokumentsammlungen wie das Boolsche Modell, das Vektorraummodell, Latent Semantic Indexing und Modelle für natürliche Sprache. Ebenso werden Evaluations-Methoden von IR-Modellen und Implementierungsaspekte diskutiert.

Im zweiten Teil werden Methoden vorgestellt, um IR-Modelle und Methoden zur Lösung von Suchproblemen in der Bioinformatik einzusetzen. Hier werden Beispiele aus den verschieden Bereichen wie Proteomics, Metabolomics, Molekülsuche, u.a. vorgestellt.