General information

Course name	Vorlesung/Übung: Regulatorische Genomik (Seminar/Übung)
Semester	WiSe 2023/24
Current number of participants	11
Home institute	Leitung des Instituts für Informatik
participating institutes	Bioinformatik
Courses type	Vorlesung/Übung in category Offizielle Lehrveranstaltungen
First date	Tuesday, 10.10.2023 16:00 - 17:30
Pre-requisites	Statistische Datenanalyse in der Bioinformatik II
Performance record	Scheinerwerb durch aktive Teilnahme an den Übungen und Lösung der Aufgaben
Studiengänge (für)	Master Bioinformatik, Master Informatik, Master Nutzpflanzenforschung
SWS	2

Lehrende

Rooms and times

Seminarraum 1.03 [VSP 1] (Informatik): Tuesday: 16:00 - 17:30, weekly (9x)
No room preference: Tuesday: 16:00 - 17:30, weekly(1x)
Seminarraum 0.03 [VSP 1]: Friday: 14:15 - 15:45, weekly (9x)
Seminarraum 0.04 [VSP 1]: Friday: 14:15 - 15:45, weekly (1x)

Fields of study

Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik

Module assignments

Agrarwissenschaft/Landwirtschaft Nutzpflanzenwiss.MA120, Akkreditierungsfassung valid from WS 2018/19 > Wahlpflichtmodule > INF.08065.01 - Regulatorische Genomik, valid from WiSe 2023/24 > LV 1: Seminar (Seminar)
Bioinformatik BioinformatikMA120, Akkreditierungsfassung valid from SoSe 2023 > Bioinformatik (HI) (Anteil gem. § 5 Abs. 4-6, Anlage 2) > INF.08065.01 - Regulatorische Genomik, valid from WiSe 2023/24 > LV 1: Seminar (Seminar)
Informatik InformatikMA120, Akkreditierungsfassung valid from SoSe 2023 > Vertiefende Module der Vertiefungsrichtung `Bioinformatik` > INF.08065.01 - Regulatorische Genomik, valid from WiSe 2023/24 > LV 1: Seminar (Seminar)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft Nutzpflanzenwiss.MA120, Akkreditierungsfassung valid from WS 2018/19 > Wahlpflichtmodule > INF.08065.01 - Regulatorische Genomik, valid from WiSe 2023/24 > LV 3: Übung (Übung)
Bioinformatik BioinformatikMA120, Akkreditierungsfassung valid from SoSe 2023 > Bioinformatik (HI) (Anteil gem. § 5 Abs. 4-6, Anlage 2) > INF.08065.01 - Regulatorische Genomik, valid from WiSe 2023/24 > LV 3: Übung (Übung)
Informatik InformatikMA120, Akkreditierungsfassung valid from SoSe 2023 > Vertiefende Module der Vertiefungsrichtung `Bioinformatik` > INF.08065.01 - Regulatorische Genomik, valid from WiSe 2023/24 > LV 3: Übung (Übung)

Comment/Description

In der Vorlesungen werden ausgewählte Probleme der Sequenzanalyse wie z. B. die Erkennung von Spleißstellen oder Transkriptionsfaktorbindungsstellen behandelt. Methodisch werden verschiedene stochastische Modelle wie z. B. PWM-Mischmodelle oder Modelle für cis-regulatorische Module diskutiert. Für diese Modelle werden EM-Algorithmen zum Parameterlernen hergeleitet und auf verschiedene Datensätze angewendet.