General information

Course name	Exercises: Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen (Übung)
Semester	WS 2022/23
Current number of participants	4
Home institute	Leitung des Instituts für Informatik
participating institutes	Bioinformatik
Courses type	Exercises in category Offizielle Lehrveranstaltungen
First date	Wednesday, 12.10.2022 10:15 - 11:45, Room: Seminarraum 1.03 [VSP 1] (Informatik)
Pre-requisites	Statistische Datenanalyse in der Bioinformatik II
Performance record	Scheinerwerb durch aktive Teilnahme an den Übungen und Lösung der Aufgaben
Studiengänge (für)	Master Bioinformatik, Master Informatik, Master Nutzpflanzenforschung
SWS	2

Lehrende

Prof. Dr. Ivo Grosse

Rooms and times

Seminarraum 1.03 [VSP 1] (Informatik): Wednesday: 10:15 - 11:45, weekly (15x)

Fields of study

Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik

Module assignments

Bioinformatik BioinformatikMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2016/17 - WS 2022/23) > Bioinformatik (HI) > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Informatik InformatikMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2006/07 - SS 2013) > Primärmodule > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Informatik InformatikMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2013/14 - SS 2016) > Vertiefende Module der Vertiefungsrichtung `Bioinformatik` > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft AgrarwissenschaftenMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2013/14 - SS 2015) > Wahlmodule Nutzpflanzen > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft Nutzpflanzenwiss.MA120, Akkreditierungsfassung valid from WS 2018/19 > Wahlpflichtmodule > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft Nutzpflanzenwiss.MA120, Akkreditierungsfassung (WS 2009/10 - SS 2015) > Wahlpflichtmodule Masterstudiengang Nutzpflanzenwissenschaften > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Bioinformatik BioinformatikMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2009/10 - SS 2016) > Bioinformatik > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Informatik InformatikMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2016/17 - WS 2022/23) > Vertiefende Module der Vertiefungsrichtung `Bioinformatik` > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft Nutzpflanzenwiss.MA120, Akkreditierungsfassung (WS 2015/16 - SS 2018) > Wahlpflichtmodule > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft AgrarwissenschaftenMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2015/16 - SS 2018) > Wahlmodule Nutzpflanzen > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)
Agrarwissenschaft/Landwirtschaft AgrarwissenschaftenMA120, Akkreditierungsfassung (WS 2018/19 - SS 2020) > Wahlmodule Nutzpflanzen > INF.02853.07 - Statistische Mustererkennung in DNA-Sequenzen, valid from WS 2006/07 > LV 3: Übung (Übung)

Comment/Description

In der Vorlesungen werden ausgewählte Probleme der Sequenzanalyse wie z. B. die Erkennung von Spleißstellen oder Transkriptionsfaktorbindungsstellen behandelt. Methodisch werden verschiedene stochastische Modelle wie z. B. PWM-Mischmodelle oder Modelle für cis-regulatorische Module diskutiert. Für diese Modelle werden EM-Algorithmen zum Parameterlernen hergeleitet und auf verschiedene Datensätze angewendet.