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Studienmodul: Algorithmen auf Sequenzen II - Details
 
  INF.00894: Algorithmen auf Sequenzen II
Aktionen:
  Modulverantwortlicher:
siehe Modulhandbuch
Semester:
WS 2017/18
  Leistungspunkte:
5
Stud. Arbeitsaufwand:
150
  Anbietende Einrichtung:
Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Institut für Informatik
Dauer:
1 Semester
  Lernziele:
  • Die TeilnehmerInnen sollen ein Verständis für Möglichkeiten und Limitationen von modernen Sequenzierverfahren entwicklen sowie die Eignung unterschiedlicher Datenanalyseverfahren für verschiednene Fragestellungen beurteilen können.
  • Die TeilnehmerInnen sollen Eigenschaften verschiedenerVerfahren zur Vorhersage der RNA-Sekundärstruktur sowie zum Strukturalignment von RNA einschätzen können.
  Inhalte:
  • Experimentelle Methodik und Eigenschaften moderner Sequenzierverfahren.
  • Algorithmen zum Read-Mapping und zur De-Novo-Assemblierung
  • Transkriptrekonstruktion und Erkennung alternativer Spleisstellen
  • SNP-Detektion
  • verschiedene Methoden zur Vorhersage der RNA-Sekundärstruktur
  • verschiedene Methoden zum Strukturalignment von RNA
 
Studiengang Studienprogramm Modulart Version der Prüfungsordnung Empfohlenes Studiensemester
Master InformatikMA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2006 2
Master BioinformatikMA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2009 1
Master InformatikMA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2013 2
Master InformatikMA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2016 1
Master BioinformatikMA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2016 3

 
Lehr- und Lernform Name der Veranstaltung Dozenten SWS Studentische Arbeitszeit Semester
1. Modulausprägung
Vorlesung Algorithmen auf Sequenzen II Grau, J. 2 30 Wintersemester
Selbststudium zur Vorlesung n.a. 0 45 Wintersemester
Übung Algorithmen auf Sequenzen II, Übung Grau, J. 2 30 Wintersemester
Bearbeiten der Übungsaufgabe n.a. 0 45 Wintersemester