Homepage MLU Halle-Wittenberg
Aktuelle Seite:
Studienmodul: Spezielle Probleme der Bioinformatik - Details
 
  INF.02514: Spezielle Probleme der Bioinformatik
Aktionen:
  Modulverantwortlicher:
siehe Modulhandbuch
Semester:
SS 2017
  Leistungspunkte:
10
Stud. Arbeitsaufwand:
300
  Anbietende Einrichtung:
Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Institut für Informatik
Dauer:
1 Semester
  Lernziele:
Im Seminarteil sollen die Studierenden den Umgang mit Originalliteratur und die Darstellung der erarbeiteten Inhalte in einem Vortrag sowie einer schriftlichen Ausarbeitung erlernen. Im Vorlesungsteil werden gängige Methoden, Werkzeugen und Programmiersprachen der Bioinformatik eingeführt und in Übungen konkrete Erfahrungen an speziellen Beispielen in kleinen Projekten erarbeitet.
  Inhalte:
Thematisch werden verschiedene Bereiche der Bioinformatik wie DNA-Sequenzierung, Alignments, Assemblierung, Erstellung genetischer Karten, Generkennung, Erkennung von Transkriptionsfaktorbindungsstellen, Rekonstruktion phylogenetischer Bäume, Analyse von Expressionsdaten und Massenspektrometriedaten, Vorhersage von Sekundär- und Tertiärstrukturen oder Proteindocking behandelt. Im praktischen Teil werden Aufgaben wie Verarbeitung von Sequenzen, Parsen von Daten- und Ergebnisdateien, Konversion zwischen Fileformaten, Datenbankanbindungen und Nutzen von Standardwerkzeugen wie Bioconductor, BLAST, Clustal, MEME, PHYLIP oder PAUP* eingeübt.
 
Studiengang Studienprogramm Modulart Version der Prüfungsordnung Empfohlenes Studiensemester
Bachelor Bioinformatik180 Pflichtmodul 1. Version 2007 5
Bachelor Bioinformatik180 Pflichtmodul 1. Version 2012 4
Master Nutzpflanzenwiss.MA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2009 2
Master AgrarwissenschaftenMA120 Wahpflichtmodul 1. Version 2013 2

 
Lehr- und Lernform Name der Veranstaltung Dozenten SWS Studentische Arbeitszeit Semester
1. Modulausprägung
Vorlesung Spezielle Probleme der Bioinformatik Grau, J. 2 30 Sommersemester
Übung Spezielle Probleme der Bioinformatik, Übung Grau, J. 2 30 Sommersemester
Übungsaufgaben und Prüfungsvorbereitung n.a. 0 90 Sommersemester
Seminar n.a. 2 30 Sommersemester
Selbststudium, Vorbereitung des Fachvortrags und E n.a. 0 90 Sommersemester
Selbststudium zur Vorlesung n.a. 0 30 Sommersemester