Seit Charles Darwin und Ernst Haeckel besteht ein Traum der Biologen darin, die evolutionäre Geschichte aller Lebewesen zu rekonstruieren und in Form eines phylogenetischen Baums darzustellen. Mit der Erfüllung dieses Traumes befasst sich die Molekulare Phylogenie. Die Vorlesung widmet sich verschiedenen Prozessen der molekularen Evolution sowie einfachen mathematischen Modellen zu deren Beschreibung. Den Kern der Vorlesung bilden verschiedene Verfahren (maximum parsimony, maximum likelihood, Bayesian inference, neighbor joining, UPGMA, etc.) zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume. Den Abschluss der Vorlesung bildet ein Ausblick auf die Modellierung und Rekonstruktion der evolutionären Geschichte mittels phylogenetischer Netzwerke.
