Seminar: Ausgewählte Kapitel der Bioinformatik - Details

Actions

• Login
• Print
• Reserve in the timetable

Share

• Copy link to this course

General information

Course number	INF.01073.01
Semester	WS 2017/18
Current number of participants	2
expected number of participants	15
Home institute	Bioinformatik
participating institutes	Institut für Informatik, Praktische Informatik (Bioinformatik)
Courses type	Seminar in category Offizielle Lehrveranstaltungen
First date	Mon , 09.10.2017 12:15 - 13:45, Room: Seminarraum 0.03 [VSP 1]
Studiengänge (für)	Master Bioinformatik, Master Informatik, Diplom Bioinformatik (Hauptstudium)
SWS	2
ECTS points	5

Lecturers

• Dr. rer. nat. Jan Grau

Course location / Course dates

Seminarraum 0.03 [VSP 1]

Monday: 12:15 - 13:45, weekly (from 09/10/17) (14x)

Fields of study

• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik > Fachrichtungen > Bioinformatik
• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik > Master
• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik > Themen > Bio-Informatik
• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik > Themen > Mustererkennung
• Naturwissenschaftliche Fakultät III - Agrarwiss., Geowiss. und Informatik > Informatik > Institut für Informatik > Themen > Programmierung

Module assignments

• Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation valid from WS 2016/17 > Bioinformatik (HI) > INF.01073.03 - Ausgewählte Kapitel der Bioinformatik, valid from WS 2006/07 > Course 1: Course (Seminar)
• Bioinformatik BioinformatikMA120, Version of accreditation (WS 2009/10 - SS 2016) > Bioinformatik > INF.01073.03 - Ausgewählte Kapitel der Bioinformatik, valid from WS 2006/07 > Course 1: Course (Seminar)
• Informatik InformatikMA120, Version of accreditation (WS 2006/07 - SS 2013) > Primärmodule > INF.01073.03 - Ausgewählte Kapitel der Bioinformatik, valid from WS 2006/07 > Course 1: Course (Seminar)

Comment/Description

In diesem Seminar beschäftigen wir uns mit aktuellen Fragestellungen und deren Lösungsansätzen im Bereich der Bioinformatik. Ein Schwerpunkt liegt hierbei auf Publikationen der letzten Jahre, die sich u.a. mit der Vorhersage von miRNA-Zielen, der de-novo Motiverkennung oder allgemein der statistischen Mustererkennung beschäftigen. Insbesondere die Untersuchung und der Vergleich verschiedener methodischer (Lern-) Ansätze sind hierbei von Interesse. Neben der theoretischen Auseinandersetzung ist auch die praktische Umsetzung eines (überschaubaren) Teiles der vorgestellten Methoden Teil der Veranstaltung. Um die praktische Umsetzung zu erleichtern, wird es in den ersten Wochen des Seminars eine überblicksartige Einführung in verschiedene Programmierbibliotheken geben.

Zu diesem Zweck wird jede/r Teilnehmer/in im ersten Teil der Veranstaltung einen wissenschaftlichen Vortrag zu einer speziellen Publikation oder zu einem abgegrenzten Themenbereich halten. Im Rahmen der Diskussion des Vortrages soll auch diskutiert werden, welche methodischen Teile sich für eine praktische Umsetzung eignen. In einer anschließenden Phase des Selbststudiums erfolgt die Umsetzung der Methodik und - soweit verfügbar - der Test auf den Originaldaten der Publikation. Die Ergebnisse werden schließlich in einem zweiten Kurzvortrag vorgestellt und mit allen Teilnehmer/innen diskutiert.
Die schriftliche Ausarbeitung, die 15 Seiten nicht übersteigen sollte, stellt schließlich die Originalpublikation (bzw. den Themenbereich) dar und berichtet über die praktische Umsetzung.