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Vorlesung: Angewandte Bioinformatik mit Perl und R - Details
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Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname Vorlesung: Angewandte Bioinformatik mit Perl und R
Untertitel im Thin-Client-Pool
Semester WS 2008/09
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden 1
erwartete Teilnehmendenanzahl 15
Heimat-Einrichtung Bioinformatik
beteiligte Einrichtungen Institut für Informatik, Praktische Informatik (Bioinformatik)
Veranstaltungstyp Vorlesung in der Kategorie Offizielle Lehrveranstaltungen
Erster Termin Donnerstag, 09.10.2008 10:15 - 11:00
Teilnehmende - wahlobl. für das 5. oder 7. Semester Bioinformatik
Leistungsnachweis Scheinerwerb durch aktive Teilnahme an den Übungen und Lösung der Aufgaben
SWS 2
Sonstiges Bei größerer Nachfrage kann eventuell eine zweite Übungsgruppe eingeführt werden

Räume und Zeiten

Keine Raumangabe
Donnerstag: 10:15 - 11:00, wöchentlich(15x)

Kommentar/Beschreibung

In der Veranstaltungen werden konkrete Aufgabenstellung aus
der Informatik mit den Programmiersprachen bzw - umgebungen
Perl/BioPerl und R/Bioconductor gearbeitet.
Als Anwendungen werden behandelt:
Manipulation von Sequenzen
Parsen von Daten- und Ergebnisdateien
Konversion zwischen Fileformaten
Filtern und Vergleichen von Datensätzen
Datenbankanbindungen

Analyse von Expressionsprofilen:
Aufbereitung und Normalisierung
Visualisierung von
Detektion signifikanter Gene
Clustern

Im Lauf der Veranstaltung werden schrittweise die programmiersprachlichen
Konzepte und der erforderliche methodische Hintergrund
für die Fragestellungen eingeführt.
Die Studierenden sollen intensiv sowohl in der Übung wie im Selbststudium
die erlernten Techniken in konkreten Projekten praktisch umsetzen.

Anmelderegeln

Diese Veranstaltung gehört zum Anmeldeset "Anmeldung gesperrt (global)".
Folgende Regeln gelten für die Anmeldung:
  • Die Anmeldung ist gesperrt.